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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一支有所作为医药化工配料而被熟记的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“代谢率垃圾”为“宝物小分子式”的辛酸史以来相近,到了近几十年才被显示其为重要的生物学功用,终究“平躺农奴把唱歌”,特意是在免疫抗体支原体感染性慢性病深入分析范围内独树一帜。不存在数篇文献资料简报了在各种各样支原体感染性慢性病的動物实体模型中付出衣康酸或其电学修饰语衍生物物的方法益处,并显示其内在靶点。介绍衣康酸的“今生今世来世”与“今生今世”,详细微信推文《乳酸的逆袭之弟弟——衣康酸!选文兜兜风认知衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸突显球蛋白组学产品,实现1000+玄之又玄度体现位点排除,可靠重新经典英文靶点,全坐向生信深入分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“遇到”到“核实”全具体流程的服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实验室操作流程

02、试验动态数据

03、经“点”显现

在监测统计数据中,检测个专著中媒体报道的有趣靶点及衣康酸绘制位点,如独另一个被察觉到的衣康酸共价绘制球血清质KEAP1,还在糖酵解径路中的3个要素酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,包括炎性小体組成球血清质NLRP3和细胞系损伤环节中的要素球血清质RIPK3等,其质谱图以下几点图如下。

04、品牌性能

1.多厚质控

商业楼化特异形探头孵育、SDS-PAGE检则、WB认可、样板有关系性概述等各种位检则,为了确保項目结果显示可信性。

2.高机械性能质谱实验室设备机构

在Orbitrap Astral全新一批高判定质谱仪支持下,保证衣康硝化作用淡化位点及核蛋白判定新深层次,注力实验研究方案新找到。

3.全工艺流程一走式售后服务

通过拜谱生物工程成熟的的实践服务性平台,可提高“体细胞培养教育→探头孵育→WB监测→玄妙度衣康碱化绘制监测→专享生信分析一下→不同位点PRM认可”全过程服务性,省时省事更皮实。

05、分折文章(组成部分)

06、拜谱生物方向盘

PART 2、文献综述讲解

文献综述一

英语怎么说标题文字:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

常常题头:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

探索內容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

文章二

国外英文主题词:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

英文版网站标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

钻研项目:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、拜谱生物衍生物一个构想

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具备有具有的底物紧密结合的能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生态学衣康过酸体现组实测值数据文件中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用淡化(如表图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人总结

作TCA反复的中的正中间基础产生物,衣康酸调准基础产生、免疫检测力抗体和宫颈慢性炎症之中的间接效果,为治療免疫检测力抗体宫颈慢性炎症性的发病打造了改用治療策略。衣康酸设计类型中的亲电性α,β-不饱和羧酸设计类型能对血清质上的活力半胱氨酸残基实现烷基化淡化(迈克尔增加反映),这一项泰语翻译后淡化被称是“衣康酸淡化(itaconation)”,于是关系血清质模块,调节免疫检测力抗体回应和基础产生渠道,为多种类的发病类药研制打造新工作思路。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸淡化血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物临床非常化学发光法靶向治疗分解组(QMT1000)或能量是什么分解代谢率靶向药物分解代谢率组食品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参考价值资料

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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